Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp46P62069 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp46P62069 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp46P62069 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp46P62069 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp46P62069 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp46P62069 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp46P62069 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp46P62069 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp46P62069 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp46P62069 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp46P62069 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp46P62069 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms