Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d1P61080 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d1P61080 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms