Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdo1P60334 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdo1P60334 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms