Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rin3P59729 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rin3P59729 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rin3P59729 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rin3P59729 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rin3P59729 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rin3P59729 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rin3P59729 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rin3P59729 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rin3P59729 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rin3P59729 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rin3P59729 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rin3P59729 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms