Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps33bP59016 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Vps33bP59016 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vps33bP59016 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms