Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paxbp1P58501 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Paxbp1P58501 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms