Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtpaP58389 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtpaP58389 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtpaP58389 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpaP58389 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpaP58389 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpaP58389 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpaP58389 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpaP58389 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpaP58389 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpaP58389 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpaP58389 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpaP58389 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpaP58389 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms