Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dpf3P58269 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dpf3P58269 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dpf3P58269 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms