Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab4aP56371 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab4aP56371 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab4aP56371 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms