Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CebpaP53566 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CebpaP53566 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CebpaP53566 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CebpaP53566 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CebpaP53566 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CebpaP53566 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CebpaP53566 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CebpaP53566 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CebpaP53566 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CebpaP53566 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CebpaP53566 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CebpaP53566 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms