Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst2P52850 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndst2P52850 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst2P52850 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms