Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ube2e3P52483 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ube2e3P52483 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2e3P52483 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms