Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1swP51491 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn1swP51491 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn1swP51491 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn1swP51491 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms