Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa9P50707 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa9P50707 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa9P50707 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa9P50707 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa9P50707 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa9P50707 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa9P50707 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa9P50707 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa9P50707 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms