Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TspoP50637 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TspoP50637 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TspoP50637 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TspoP50637 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TspoP50637 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TspoP50637 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TspoP50637 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TspoP50637 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TspoP50637 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TspoP50637 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TspoP50637 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TspoP50637 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TspoP50637 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TspoP50637 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TspoP50637 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TspoP50637 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TspoP50637 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TspoP50637 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TspoP50637 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TspoP50637 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TspoP50637 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TspoP50637 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TspoP50637 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms