Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FmodP50608 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FmodP50608 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FmodP50608 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FmodP50608 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FmodP50608 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FmodP50608 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FmodP50608 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FmodP50608 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FmodP50608 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FmodP50608 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FmodP50608 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FmodP50608 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FmodP50608 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FmodP50608 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FmodP50608 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FmodP50608 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FmodP50608 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FmodP50608 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FmodP50608 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FmodP50608 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FmodP50608 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FmodP50608 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FmodP50608 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FmodP50608 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FmodP50608 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FmodP50608 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms