Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TubP50586 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TubP50586 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TubP50586 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TubP50586 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TubP50586 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TubP50586 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TubP50586 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TubP50586 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TubP50586 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TubP50586 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TubP50586 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TubP50586 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TubP50586 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TubP50586 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TubP50586 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TubP50586 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TubP50586 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TubP50586 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TubP50586 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TubP50586 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TubP50586 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TubP50586 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TubP50586 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TubP50586 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TubP50586 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TubP50586 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TubP50586 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TubP50586 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TubP50586 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TubP50586 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TubP50586 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TubP50586 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TubP50586 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TubP50586 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TubP50586 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TubP50586 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TubP50586 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TubP50586 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TubP50586 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TubP50586 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TubP50586 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TubP50586 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TubP50586 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TubP50586 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TubP50586 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TubP50586 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TubP50586 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TubP50586 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TubP50586 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TubP50586 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TubP50586 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TubP50586 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TubP50586 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TubP50586 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TubP50586 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TubP50586 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms