Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LtbrP50284 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LtbrP50284 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LtbrP50284 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbrP50284 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LtbrP50284 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LtbrP50284 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LtbrP50284 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LtbrP50284 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LtbrP50284 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms