Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn1cP49919 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn1cP49919 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms