Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hcls1P49710 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcls1P49710 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcls1P49710 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcls1P49710 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms