Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb42P49222 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb42P49222 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb42P49222 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb42P49222 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epb42P49222 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb42P49222 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms