Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptx3P48759 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ptx3P48759 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptx3P48759 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms