Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcd1P48410 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcd1P48410 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcd1P48410 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcd1P48410 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 948.2 ms