Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpl5P47962 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl5P47962 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl5P47962 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms