Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf4P47741 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf4P47741 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf4P47741 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf4P47741 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms