Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf4P43488 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf4P43488 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf4P43488 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf4P43488 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms