Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgavP43406 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgavP43406 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgavP43406 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgavP43406 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgavP43406 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgavP43406 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgavP43406 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgavP43406 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgavP43406 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms