Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf5P43027 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf5P43027 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdf5P43027 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf5P43027 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms