Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-5P42582 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nkx2-5P42582 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-5P42582 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms