Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CskP41241 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CskP41241 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CskP41241 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CskP41241 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CskP41241 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CskP41241 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CskP41241 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CskP41241 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CskP41241 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CskP41241 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CskP41241 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CskP41241 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CskP41241 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CskP41241 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CskP41241 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CskP41241 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CskP41241 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CskP41241 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CskP41241 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CskP41241 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CskP41241 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CskP41241 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CskP41241 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CskP41241 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CskP41241 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CskP41241 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CskP41241 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CskP41241 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CskP41241 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CskP41241 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CskP41241 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CskP41241 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CskP41241 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CskP41241 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CskP41241 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CskP41241 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CskP41241 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CskP41241 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CskP41241 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CskP41241 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CskP41241 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CskP41241 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CskP41241 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CskP41241 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CskP41241 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CskP41241 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CskP41241 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CskP41241 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CskP41241 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CskP41241 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CskP41241 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CskP41241 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CskP41241 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CskP41241 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CskP41241 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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