Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighmbp2P40694 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighmbp2P40694 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ighmbp2P40694 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighmbp2P40694 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms