Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp3P39876 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timp3P39876 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp3P39876 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp3P39876 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp3P39876 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms