Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Folr1P35846 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Folr1P35846 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Folr1P35846 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Folr1P35846 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Folr1P35846 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Folr1P35846 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Folr1P35846 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Folr1P35846 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Folr1P35846 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Folr1P35846 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms