Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn1P35821 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn1P35821 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptpn1P35821 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn1P35821 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms