Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddit3P35639 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddit3P35639 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddit3P35639 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddit3P35639 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms