Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpardP35396 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpardP35396 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpardP35396 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpardP35396 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PpardP35396 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PpardP35396 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PpardP35396 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PpardP35396 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PpardP35396 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PpardP35396 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PpardP35396 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PpardP35396 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpardP35396 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PpardP35396 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PpardP35396 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PpardP35396 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PpardP35396 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpardP35396 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpardP35396 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpardP35396 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpardP35396 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpardP35396 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpardP35396 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PpardP35396 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PpardP35396 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PpardP35396 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PpardP35396 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpardP35396 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpardP35396 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpardP35396 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpardP35396 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpardP35396 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpardP35396 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpardP35396 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpardP35396 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpardP35396 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpardP35396 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpardP35396 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpardP35396 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpardP35396 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpardP35396 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpardP35396 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpardP35396 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpardP35396 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpardP35396 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpardP35396 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpardP35396 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpardP35396 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpardP35396 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpardP35396 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpardP35396 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpardP35396 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpardP35396 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpardP35396 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PpardP35396 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PpardP35396 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpardP35396 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpardP35396 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpardP35396 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpardP35396 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpardP35396 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpardP35396 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpardP35396 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpardP35396 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpardP35396 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpardP35396 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpardP35396 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpardP35396 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpardP35396 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpardP35396 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpardP35396 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpardP35396 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpardP35396 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpardP35396 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpardP35396 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpardP35396 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpardP35396 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PpardP35396 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PpardP35396 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PpardP35396 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpardP35396 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PpardP35396 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpardP35396 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpardP35396 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpardP35396 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpardP35396 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpardP35396 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms