Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab3dP35276 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3dP35276 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3dP35276 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms