Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apoc1P34928 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apoc1P34928 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms