Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola2P33611 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola2P33611 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola2P33611 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pola2P33611 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pola2P33611 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pola2P33611 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pola2P33611 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms