Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nedd1P33215 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd1P33215 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nedd1P33215 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 662.9 ms