Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk4P30285 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk4P30285 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk4P30285 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.7 ms