Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprmP28828 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprmP28828 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprmP28828 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprmP28828 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprmP28828 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprmP28828 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprmP28828 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprmP28828 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprmP28828 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PtprmP28828 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprmP28828 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprmP28828 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprmP28828 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
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