Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9P28357 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxd9P28357 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd9P28357 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms