Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa3P28310 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa3P28310 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa3P28310 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa3P28310 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa3P28310 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa3P28310 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms