Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja4P28235 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja4P28235 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja4P28235 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja4P28235 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja4P28235 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja4P28235 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja4P28235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja4P28235 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja4P28235 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja4P28235 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms