Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CenpbP27790 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CenpbP27790 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpbP27790 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpbP27790 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpbP27790 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpbP27790 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpbP27790 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpbP27790 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpbP27790 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CenpbP27790 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CenpbP27790 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpbP27790 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpbP27790 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpbP27790 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpbP27790 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms