Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarsP26638 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarsP26638 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarsP26638 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarsP26638 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SarsP26638 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SarsP26638 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SarsP26638 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SarsP26638 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SarsP26638 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarsP26638 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarsP26638 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarsP26638 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarsP26638 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarsP26638 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarsP26638 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarsP26638 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarsP26638 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarsP26638 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarsP26638 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarsP26638 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarsP26638 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarsP26638 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarsP26638 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarsP26638 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarsP26638 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarsP26638 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarsP26638 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarsP26638 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarsP26638 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SarsP26638 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarsP26638 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarsP26638 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarsP26638 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarsP26638 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarsP26638 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SarsP26638 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SarsP26638 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SarsP26638 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarsP26638 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarsP26638 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarsP26638 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarsP26638 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarsP26638 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarsP26638 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarsP26638 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarsP26638 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarsP26638 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarsP26638 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarsP26638 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SarsP26638 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.3 ms