Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChgaP26339 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChgaP26339 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChgaP26339 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChgaP26339 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChgaP26339 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChgaP26339 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ChgaP26339 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChgaP26339 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ChgaP26339 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ChgaP26339 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChgaP26339 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms