Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd247P24161 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd247P24161 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd247P24161 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd247P24161 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd247P24161 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd247P24161 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd247P24161 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd247P24161 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms