Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf8P23611 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf8P23611 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf8P23611 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf8P23611 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf8P23611 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf8P23611 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf8P23611 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf8P23611 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf8P23611 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms